ゲル抽キットをpromegaに変えたら収量が劇的に増えた
僕の研究室で使っていたゲル抽キットは日本のとある有名メーカーのものだったのですが、収量がものすごく悪かったんです。
1μgを泳動して、回収できたのはせいぜい200ngとかその程度でした。
キットに書かれていた通り、カラム精製の時に温めたり、なんかよくわからない試薬を入れても効果はほとんどなし。
この収率ではクローニングをするにも心もとなくて、どうにかなんないかなぁ悩んでいました。
そこで先日、思い切ってキットを別のメーカーにしてみました。
今回買ってみたのはpromegaのWizard® SV Gel and PCR Clean-Up Systemというキット。
公式のページによると回収率は以下の通りの様です。
DNA断片長ごとの回収率
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DNA断片長 | 回収率 |
55bp | 26% |
70bp | 39% |
85bp | 55% |
100bp | 84% |
500bp | 89% |
1,000bp | 92% |
3,199bp | 95% |
9,416bp | 95% |
23,130bp | 47% |
さて、実際の回収率はというと
500bpほどのPCRフラグメントを1μgゲル抽して650ng回収出来ました(1%ゲルを使用)。
公式では90%程回収できるとされていますが、実質は65%でした。
まあ、前回のキットの回収率は良くて25%だったのでなかなか良いキットだと言えます。
260/230は約1.8
260/280は約1.3
でクオリティーには問題ありません。
泳動の写真も大丈夫でした。
ちなみに、ラボの他のメンバーが使っても同じような結果でしたのでこの収率には信頼性はあるみたいです。
あっ、あとPCRのクリーンナップだけのカラム精製ならば収率は9割近くいきましたのでとっても満足しています。
ゲル抽の収率で悩んでいる方はこのキットなかなかいいかもしれませよ。